Racines qui Pourrissent en Aquaponie : Causes, Diagnostic et Solutions

Qu'est-ce que la pourriture des racines ?

La pourriture racinaire est une maladie des plantes causée par des conditions anaérobies (manque d'oxygène) ou par des agents pathogènes fongiques/bactériens, qui entraînent la décomposition des tissus racinaires. Les racines perdent leur capacité à absorber l'eau et les nutriments, ce qui se manifeste par un affaiblissement de la partie aérienne de la plante.

Causes principales de la pourriture des racines

Le manque d'oxygène est le facteur le plus courant :

• Manque d'oxygène dissous (OD) : C'est la cause numéro un. Les racines des plantes, comme les poissons, ont besoin d'oxygène. Si l'eau est mal aérée ou si elle stagne, les racines sont privées d'oxygène, créant un environnement propice aux bactéries anaérobies qui causent la pourriture.
• Excès d'eau/Mauvais drainage : Dans les systèmes sur substrat (media beds), un drainage insuffisant peut laisser les racines constamment submergées, les privant d'air et créant des zones anaérobies. Un siphon de cloche défectueux peut en être la cause.
• Température de l'eau élevée : Une eau trop chaude réduit la capacité de l'eau à retenir l'oxygène dissous, augmentant le risque de pourriture.
• Agents pathogènes : Bien que moins fréquents dans un système aquaponique sain, certains champignons ou bactéries peuvent attaquer les racines, surtout si les plantes sont déjà stressées.
• Accumulation de déchets solides : Des débris organiques (restes de nourriture, excréments de poissons) qui s'accumulent dans les lits de culture ou autour des racines peuvent consommer l'oxygène et favoriser les conditions anaérobies.
• Problème de pompe ou d'aération : Une pompe défectueuse ou une aération insuffisante du bassin des poissons peut réduire l'oxygène dans tout le système.

Conséquences sur votre système

La pourriture des racines a des effets dévastateurs sur les plantes :

• Affaiblissement des plantes : Les plantes touchées montrent des signes de flétrissement, une croissance ralentie (voir guide) et un jaunissement des feuilles (voir guide), car elles ne peuvent plus absorber l'eau et les nutriments.
• Mort des plantes : Sans intervention, les plantes finiront par mourir.
• Déséquilibre du système : Les racines pourries peuvent dégager des odeurs désagréables et introduire des pathogènes qui affectent l'ensemble de l'écosystème, y compris les poissons.

Diagnostic rapide

La détection est souvent visuelle et olfactive :

• Examen visuel des racines : Sortez délicatement une plante de son support et examinez les racines.
  • Racines saines : Blanches ou claires, fermes.
  • Racines pourries : Brunes, noires, molles, visqueuses, se désagrègent facilement au toucher.
• Odeur : Les racines pourries peuvent dégager une odeur d'œuf pourri (sulfure d'hydrogène) ou de moisi.
• État de la plante : Flétrissement, jaunissement des feuilles, croissance stagnante.
• Test de l'eau : Si possible, vérifiez le niveau d'oxygène dissous (OD) dans le bassin des poissons et dans les lits de culture. Des niveaux bas (inférieurs à 4-5 mg/L) sont un signal d'alarme. Le pH peut aussi être affecté.

Solutions immédiates

Agissez rapidement pour sauver vos plantes :

• Améliorer l'oxygénation :
  • Augmentez l'aération dans le bassin des poissons (pompe à air plus puissante, diffuseurs supplémentaires).
  • Assurez-vous que l'eau circule bien et que toutes les parties du système sont correctement oxygénées.
• Nettoyage et taille des racines :
  1. Retirez délicatement les plantes affectées.
  2. Rincez les racines à l'eau claire pour enlever les débris.
  3. Coupez toutes les parties des racines qui sont brunes, molles ou visqueuses avec des ciseaux propres et stérilisés. Ne laissez que les racines saines et fermes.
  4. Repérez la plante dans le système.
• Ajuster les niveaux d'eau (lits de culture) : Si vous utilisez des lits sur substrat, assurez-vous que le cycle de remplissage/drainage fonctionne correctement et que les racines ne restent pas constamment immergées. Le substrat doit avoir une phase de drainage suffisante pour que l'air puisse atteindre les racines.
• Réduire la matière organique : Siphonnez les débris et les sédiments du bassin des poissons et des filtres. Nettoyez vos filtres régulièrement.
• Contrôler la température de l'eau : Si l'eau est trop chaude, prenez des mesures pour la refroidir (ombrage, ventilation, ajouts d'eau fraîche).

Prévention de la pourriture racinaire

Maintenir des conditions saines en continu :

• Aération adéquate : C'est la mesure préventive la plus importante. Assurez une oxygénation suffisante de toute l'eau du système.
• Bonne gestion du drainage : Pour les systèmes sur substrat, vérifiez régulièrement le fonctionnement du siphon pour un cycle de remplissage/drainage optimal.
• Éviter la surpopulation et la suralimentation : Cela réduit la charge organique et maintient une meilleure qualité de l'eau.
• Nettoyage régulier : Éliminez les débris solides et maintenez les filtres propres pour éviter l'accumulation de matière organique.
• Surveillance de la température : Maintenez la température de l'eau dans la plage idéale pour vos espèces de poissons et de plantes.